Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC106Q9BWC9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms