Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms