Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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