Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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KCNS3Q9BQ31 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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