Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT140Q96RY7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT140Q96RY7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT140Q96RY7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms