Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CAMKK2Q96RR4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAMKK2Q96RR4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms