Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP3Q96P20 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms