Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms