Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDC1Q96MU7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDC1Q96MU7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms