Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf72Q96LT7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms