Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CPNE2Q96FN4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms