Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM12Q96EX1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms