Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms