Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RNF183Q96D59 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RNF183Q96D59 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RNF183Q96D59 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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RNF183Q96D59 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RNF183Q96D59 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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