Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCTD12Q96CX2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD12Q96CX2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms