Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms