Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF4Q8WZA2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms