Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms