Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC21AQ8NDW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
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