Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms