Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAAF3Q8N9W5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms