Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms