Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM1Q8IZ96 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms