Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms