Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG4DQ86TL0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms