Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT27Q7Z3Y8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms