Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms