Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms