Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED8Q6PL24 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED8Q6PL24 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms