Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms