Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF20Q5VT98 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms