Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D3Q587I9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms