Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LACTB2Q53H82 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms