Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms