Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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