Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP2Q16527 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms