Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF56Q15929 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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