Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 526.29■■□□□ 1.82e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 223.08■■□□□ 1.292e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.242e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 SETD5-214ENST00000463180 685 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 CES1-206ENST00000565403 540 ntTSL 520.38■□□□□ 0.852e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 CES1-204ENST00000563005 1002 ntTSL 514.86□□□□□ -0.032e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 SETD5-221ENST00000478475 477 ntTSL 48.49□□□□□ -1.052e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 ADGRG6-211ENST00000538281 591 ntTSL 36.18□□□□□ -1.422e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 ADGRG6-212ENST00000540208 652 ntTSL 35.56□□□□□ -1.522e-8■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.392e-29■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.382e-20■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.96■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 421.22■□□□□ 0.991e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 420.83■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 418.98■□□□□ 0.631e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 317.4■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 217.31■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 525.69■■□□□ 1.74e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.574e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)23.01■■□□□ 1.274e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PPIF-204ENST00000492149 646 ntTSL 218.96■□□□□ 0.634e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PPIF-203ENST00000472580 761 ntTSL 518.74■□□□□ 0.594e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PPIF-205ENST00000498681 518 ntTSL 218.74■□□□□ 0.594e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 PLEKHH3-207ENST00000591490 4339 ntTSL 216.6■□□□□ 0.254e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 AZIN1-207ENST00000520402 660 ntTSL 414.8□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 FAM53C-208ENST00000511276 571 ntTSL 414.73□□□□□ -0.054e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 AZIN1-206ENST00000518940 574 ntTSL 39.85□□□□□ -0.834e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 57.84□□□□□ -1.154e-9■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.744e-9■□□□□ 9.4
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PCBP1Q15365 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-9■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 F2-204ENST00000490274 545 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-9■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-33■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-33■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-33■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 UBA2-210ENST00000607361 754 ntTSL 228.25■■■□□ 2.112e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 223.94■■□□□ 1.422e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 UBA2-205ENST00000590048 847 ntTSL 316.57■□□□□ 0.242e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-11■□□□□ 9.3
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PCBP1Q15365 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 211.53□□□□□ -0.562e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.82e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 YWHAE-206ENST00000496706 732 ntTSL 37.75□□□□□ -1.172e-11■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 GSN-201ENST00000373806 879 ntTSL 220.87■□□□□ 0.934e-9■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 218.49■□□□□ 0.551e-15■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 513.28□□□□□ -0.281e-15■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-16■□□□□ 9.3
PCBP1Q15365 MLLT6-202ENST00000612066 527 ntTSL 214.7□□□□□ -0.066e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 521.32■■□□□ 12e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 VASP-207ENST00000588482 804 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-204ENST00000482718 541 ntTSL 229.49■■■□□ 2.311e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-206ENST00000491109 637 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 310.75□□□□□ -0.697e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.867e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.127e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.27e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.237e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 56.19□□□□□ -1.427e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.597e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.757e-12■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 MAN2A2-225ENST00000560880 718 ntTSL 28.15□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-14■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 APOA2-202ENST00000463273 469 ntTSL 1 (best)10.16□□□□□ -0.782e-45■□□□□ 9.2
PCBP1Q15365 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-21■□□□□ 9.1
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