Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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