Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GPNMBQ14956 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GPNMBQ14956 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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GPNMBQ14956 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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GPNMBQ14956 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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GPNMBQ14956 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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GPNMBQ14956 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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GPNMBQ14956 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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GPNMBQ14956 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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GPNMBQ14956 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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