Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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