Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRCAPQ14761 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms