Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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