Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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