Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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