Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPSQ13938 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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