Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBA3CQ13748 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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