Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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