Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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