Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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